Kullanılan insan genomu büyük bir değişikliğe uğradı

Bilim insanları 20 yılı aşkın bir müddettir genomik çalışmalar yapmak için tıpkı insan genom dizisini kullanıyor, lakin bir mühlet evvel genom dizisinde büyük bir değişiklik yapıldı. Araştırmacılar, orjinal referans genom dizisini büyük ölçüde genişleten, dönüm noktası niteliğindeki gelişmede, daha kapsayıcı yeni bir referans insan genom dizisi koleksiyonu yayınladı.

REFERANS OLAN İNSAN GENOMU DEĞİŞTİRİLDİ

Donanımhaber’in Nature mecmuasında yayınlanan hakemli makaleyi aktardığı üzere yeni pangenom referansı, dünyanın dört bir yanından 47 kişinin genom dizilerini içeriyor. Yepyeni referans insan genom dizisi, toplamda yaklaşık 20 şahıstan bileşenler içermesine karşın genel manada tek bir bireye dayanıyordu.

Yeni pangenom global gen havuzunu daha âlâ yansıttığından, bilim insanları hastalıkla ilgili genetik varyasyonları daha yanlışsız bir halde tanımlamak için kullanabilecekler. Araştırmacılara nazaran, daha çeşitli referans haritası, nihayetinde bireyin DNA’sına nazaran uyarlanmış daha şahsileştirilmiş aşı yahut tedavilerin geliştirilmesine yardımcı olmak için de kullanılacak.

Genom, bir organizmanın büyümesi ve fonksiyon görmesi için gerekli olan DNA talimatlarının tamamı olarak özetlenebilir. Bilim insanları, insanları eşsiz kılan varyasyonları incelemek için kullanabilecekleri bir “standart” oluşturmak üzere referans bir insan genomuna güvenmekte. Ortalama olarak, insanların genomları yaklaşık yüzde 99 oranında birebirdir, lakin küçük farklılıklar bilim beşerlerine bir bireyin sıhhatini etkileyebilecek özellikler hakkında fikir verebilir. Yüzde 1, kimi durumda geri kalandan “büyük” olabilir.

Makalenin müellifi Wen-Wei Liao yaptığı açıklamada, “Bir pangenom referansı ile genler ve hastalık özellikleri ortasındaki temasa dair anlayışımızı geliştirerek klinik araştırmaları hızlandırabiliriz” dedi. Pangenom, tüm genom dizilerini hizalamak için gelişmiş hesaplama teknikleri kullanmakta.

Açıklamada, bu tekniklerin 100 milyondan fazla yeni DNA harfi ekleyerek özgün referansın bıraktığı boşlukları doldurmaya yardımcı olduğu belirtildi. Liao, “İnsan pangenom referansı, genomun daha evvel erişilemeyen bölgelerindeki on binlerce yeni genomik varyantı temsil etmemizi sağlayacak” tabirlerini kullandı. Yapılan araştırma ise Ulusal Sıhhat Enstitülerinin bir kısmı tarafından finanse edilen İnsan Pangenom Referans Konsorsiyumu’ndaki bilim insanları yürüttü.